Metagenomik

I dagens artikel ska vi fördjupa oss i den spännande världen av Metagenomik, för att upptäcka alla dess hemligheter, berättelser och kuriosa. Metagenomik är ett ämne som har fångat många människors uppmärksamhet genom historien, och det är inte konstigt, eftersom dess betydelse och inverkan på våra liv är obestridlig. Utefter dessa linjer kommer vi att utforska olika aspekter av Metagenomik, från dess ursprung till dess relevans idag, genom dess implikationer i samhälle, teknik och kultur. Gör dig redo att fördjupa dig i en fascinerande resa genom Metagenomik, och upptäck allt som gör detta ämne till en outtömlig källa till kunskap och känslor.

Schematisk bild över hur metagenomik kan gå till.

Metagenomik är inom biologi studiet av metagenom, vilket är alla genom, från olika organismer, inom ett visst prov från en provtagning eller inom en viss typ av miljö. Metagenomik används främst för att studera ett områdes mikrobiella sammansättning eller för att identifiera och studera mikroorganismer som inte går att kultivera med metoder som bakterieodling. Väldigt få arter av bakterier, arkéer och encelliga eukaryoter går att isolera och odla enskilt, och representerar en väldigt liten del av del totala biodiversiteten. Detta gör metagenomik mycket viktigt för att identifiera olika typer av bakterier, arkéer och encelliga eukaryoter samt för att förstå deras evolutionära släktskap.[1]

Om ett metagenom DNA-sekvenseras för alla gener, istället för enskilda markörer som 16S, och sedan analyseras med bioinformatiska metoder så kan enskilda genom eller delar av dem identifieras ur metagenomet för att sedan analyseras individuellt. Detta har till exempel använts för att identifiera och beskriva Lokiarchaeota, ett fylum av arkéer.[2]

Se även

Referenser

  1. ^ Garrido-Cardenas, Jose Antonio; Manzano-Agugliaro, Francisco (2017-04-11). ”The metagenomics worldwide research” (på engelska). Current Genetics 63 (5): sid. 819–829. doi:10.1007/s00294-017-0693-8. ISSN 0172-8083. https://link.springer.com/article/10.1007/s00294-017-0693-8. Läst 1 december 2018. 
  2. ^ Spang, Anja; Saw, Jimmy H.; Jørgensen, Steffen L.; Zaremba-Niedzwiedzka, Katarzyna; Martijn, Joran; Lind, Anders E. (2015-05-14). ”Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes”. Nature 521 (7551): sid. 173–179. doi:10.1038/nature14447. ISSN 1476-4687. PMID 25945739. PMC: PMC4444528. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25945739. Läst 1 december 2018.